ביצוע של יבוש בהקפאה, גורם לדגימות המיובשות להיות יציבות יותר, במיוחד עבור תרופות רגישות לטמפרטורה גבוהה.
את רובן ניתן להעביר ולאחסן בטמפרטורה של 0-4℃ או בטמפרטורה החדר כך שעלות ההובלה והאחסון והסיכון לאי-אקטיבציה מופחתים מאוד.
בהשוואה לשיטות הייבוש המסורתיות, החומרים הביו-אקטיביים יכולים לשחזר את המבנה המיובש בטרם ההקפאה ואת תפקודם הביולוגי לאחר פירוק מחדש. לכן, ייבוש בהקפאה היא השיטה הבטוחה ביותר עם הכי פחות השפעה על תכונות חומרי הייבוש
